A mediados del pasado año 2007 rápidamente desarrolle un programa que permite embeber código html dentro de los reportes que BLAST genera al terminar de hacer un alineamiento y surge como necesidad para la interfaz Query Sequence Visualizer ya que la interfaz tiene un modulo que permite alinear secuencias mediante blast, pero el reporte resultante [...]
Archive for the ‘blast’ Category
Blast Query Sequence Visualizer Beta
Posted: July 17, 2008 by jacobnix in ajax, bioinformatics, blast, dojotoolkit, google, mono, mono-csharp, projectsHe dado un paso de saltar del track de versión 0.x al track 1.x !!!! Siguiendo con la interfaz para la representación gráfica de las secuencias, he actualizado muchas cosas, he corregido errores, aclaro hay mas bichos por eliminar, y he añadido mas funcionalidad respetando como siempre la interacción con el usuario final ya que [...]
Blast Query Sequence Visualizer III
Posted: May 10, 2008 by jacobnix in blast, dojotoolkit, mono-csharp, projectsde acuerdo a mi “changeLog” solo he añadido lo siguiente al sistema: * (6/05/08) cuchareada para obtener el id completo y la(s) referencia(s) que vienen en los campos hit_id o también en el campo hit_def (status: complete). * (7/05/08) dijit panel desplegable contenedor de todos los HSP’s por cada hit con la información completa que [...]
Blast Query Sequence Visualizer Demo II
Posted: May 7, 2008 by jacobnix in blast, projects, software libreretomando el tema de Blast, entre otras cosas actualice la interfaz para mostrar los datos de cada HSP de forma instantánea, aquí dejo un par de imágenes: (puedes hacer clic sobre las imágenes para agrandar) casi cualquier elemento de la pagina web “esta vivo”, los datos que se muestran instantáneamente al pasar el puntero del [...]
