Software Freedom Day Guanajuato 2011

Las ultimas imágenes de lo sucedido en nuestro evento Software Freedom Day Guanajuato 2011. El software libre es único, nos ha permitido relacionarnos con mas personas con el mismo espíritu de ayudar a los demás, hacer amigos, convivir, compartir nuestros conocimientos, exponer proyectos que poco o mucho vamos aportando en la medida de nuestras posibilidades, finalmente todos aportamos nuestro granito de arena al Software Libre, la idea es no perder el animo de seguir organizando este tipo de eventos, nos vemos el próximo año y gracias a todos.

ahhh pero qué rico cafecito en las palomas !!!

Bioscope goes to Ubuntu Linux Desktop and Server

Es bien sabido que la herramienta No. #1 de Applied Biosystems – Life Technologies , el BioScope, corre solo en un cluster de computo ,usando Torque-PBS o SGE, basado en CentOS, una distribución basada en Red Hat Linux.

En resumen BioScope te permite hacer análisis de los datos del instrumento SOLiD a través de tu navegador web y linea de comandos en Linux.

No hace mas de 2 años que encontré la manera de añadir contenido dentro de la aplicación como tal, a lo cual le llamaría crackear la aplicación pero evitare usar ese termino porque las aguas se levantan y ya chole…ayy el mexicano.

Pensé que quizá y observando que oficialmente no añaden el soporte para ensamblar genomas, dije seria bueno añadirle esas opciones al BioScope para lo cual ya tenia un esquema, diseño y el flujo de como hacerlo, pero después pensé que mejor no, puesto que no es mi aplicación , no es software libre y tendría que estar haciendo constantemente ingeniera inversa para lograr el objetivo y quizá después tendría problemas legales ya que quizá los usuarios del BioScope querrían tener estos nuevas actualizaciones,lo cual traería una seria de cuestiones legales.

Después me fastidio que BioScope solo pudiera correr en CentOS y empece analizar scripts y mas scripts con toda calma y dije !! solución !! al menos voy a hacer que BioScope puede ejecutarse en otra distro diferente a la basada en Red Hat, y dicho y hecho El servidor de BioScope ahora puede instalarse y correr en Ubuntu Linux Desktop y Server , mapreads puede correr bien sin mucho problema , ahora ya podrías analizar tus datos de SOLiD en tu propia computadora con Ubuntu Linux sin necesidad de tener que instalarte CentOS Linux.

No solo eso también puedo soportar que se ejecute en Mandriva Desktop, Gentoo, claro necesitas al menos de 16G – 24 G en memoria ram si quieres que trabaje mas o menos decentemente.

Trinity Desktop

Si el escritorio KDE en su versión 4 .x no es la mejor opción para ti y deseas seguir usando las versiones anteriores del escritorio KDE entonces tu opción puede ser el proyecto Trinity. La idea de Trinity es mantener KDE 3.5 y afinarlo en todo los puntos que se pueda y lo interesante es que se tienen muy buenas mejoras.

Para instalarlo en Ubuntu Maverick (la versión que actualmente estoy usando ) solo hay que seguir los siguientes pasos:

Añade las siguientes lineas a tu archivo /etc/apt/sources.list

deb http://ppa.quickbuild.pearsoncomputing.net/trinity/trinity/ubuntu maverick main
deb-src http://ppa.quickbuild.pearsoncomputing.net/trinity/trinity/ubuntu maverick main
deb http://ppa.quickbuild.pearsoncomputing.net/trinity/trinity-builddeps/ubuntu maverick main
deb-src http://ppa.quickbuild.pearsoncomputing.net/trinity/trinity-builddeps/ubuntu maverick main


Para instalar :

$ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.quickbuild.pearsoncomputing.net --recv-keys 2B8638D0
$ sudo apt-get update sudo apt-get install desktop-base-trinity kde-trinity

postgreSql libPerl-dev

Ahora que estuve probando un poco el Torrent Server virtual de Ion Torrent tuve que  compilarme postgreSql sobre mi caja de linux ya que necesitaba interactuar con el servidor de Ion..pero como siempre me sucede algún error a tiempo de compilación que rápidamente solucione y es que tuve a bien configurar postgreSql con soporte de Perl y Python para el lenguaje de programación en postgreSql, esto con el fin de que  te permitas desarrollar tus propios scripts para por ejemplo crear funciones automatizadas que el propio servidor de postgreSql pueda ejecutar dejando un poco libre a la aplicación de validar o realizar tareas repetitivas o bien “triggers” , “store procedures” ..etc.

Básicamente el problema fue que no tenia instalado las librerías de desarrollo de Perl ..eso es todo.

Pero sigamos a detalle la pequeña bitácora..

1. Al momento de compilar, claramente se puede observar que no se encuentra la lib “libperl.so” ..bueno gcc no dice eso exactamente, pero al momento de compilar y enlazar no se genera “plperl.so” y ahí termina el proceso.

gcc -O2 -Wall -Wmissing-prototypes -Wpointer-arith -Wdeclaration-after-statement -Wendif-labels -fno-strict-aliasing -fwrapv -fpic -shared  plperl.o spi_internal.o SPI.o  -L/usr/local/lib -L/usr/lib/perl/5.10/CORE -L../../../src/port -fstack-protector -lperl -ldl -lm -lpthread -lc -lcrypt -Wl,-rpath,’/usr/lib/perl/5.10/CORE’ -o plperl.so
/usr/bin/ld: cannot find -lperl
collect2: ld returned 1 exit status
make[3]: *** [plperl.so] Error 1
make[3]: Leaving directory `/home/jacob/Downloads/postgresql-8.4.8/src/pl/plperl’

pero para ello use la siguiente configuración:

./configure – - with-tcl – - with-perl – - with-python – - with-libxml – - with-libxslt – - prefix=/usr

2. Basta con instalar la librería , en el caso de Ubuntu Linux puedes hacerlo de la siguiente manera:

$sudo apt-get update; sudo apt-get install libperl-dev

3. finalmente comprobando con dpkg :

/usr
/usr/lib
/usr/lib/libperl.a
/usr/lib/libperl.so
/usr/share
/usr/share/doc
/usr/share/doc/libperl-dev

4. continuar con la compilación de PostgreSql.

$ sudo make install

asunto solucionado

 

Security Storage: KeePassX for GNU/Linux

KeePassX es una aplicación que al menos para mi está genial ya que permite almacenar objetos asociados a usuarios y contraseñas a una base de datos de la misma aplicación.

Para compilar Keepass necesitas tener instalada la versión de Qt >= 4.3.0 y usar desde linea de comandos :

qmake-qt4/qmake

make; make install

por omisión KeePassX se instala en /usr al momento de hacer make install.

Puedes agrupar los objetos que defines y crear entradas en cada grupo.

Hotot: The hottest new Twitter app for GNU/Linux

Hotot es una aplicación excelente para Twitter muy rápida.Aún no hay un versión estable para descargar pero puedes usar una versión de pruebas que funciona muy bien como te muestro en la siguiente captura de pantalla:

¿Como instalar Hotot en Ubuntu Linux?

1. añadir el repositorio en Ubuntu, yo hice las pruebas en Ubuntu 10.04 (Lucid)

sudo add-apt-repository ppa:hotot-team

2. instalar hotot

sudo apt-get update && sudo apt-get install hotot

miMac con Ubuntu 10.04 y KDE

En semanas pasadas después de revivir la mac del trabajo le instale Ubuntu 10.04 y KDE como software para el escritorio , realmente me gusta mucho GNOME y KDE.

Wine: Applian FLV Player

Una manera rápida, fácil y sencilla para reproducir vídeos FLV en Ubuntu Linux es usar el reproductor Applian FLV Player, el cual es gratis, pero NO libre.

Para usarlo necesitas Windows 2000/XP/Vista y Windows 7

Gracias al proyecto Wine podemos ejecutar el reproductor de vídeo en Linux como si estuviéramos en Microsoft Windows.

Para descargar el reproductor de vídeo hazlo desde la siguiente liga : http://flv-player.softonic.com/

Para instalarlo necesitamos instalar Wine en nuestra distribución de Linux favorita, si estas usando Ubuntu Linux puedes hacerlo directamente desde Synaptic o desde el centro de software de Ubuntu Linux. de igual manera puedes descargar directamente los paquetes necesarios para tu distribución favorita desde el sitio de descargas de Wine:

http://www.winehq.org/download/

A continuación desde la consola tecleamos lo siguiente:

$ wine /ruta/a/FLVPlayerSetup.exe

Seguimos las instrucciones del programa de instalación como si fuese Microsoft Windows

Una vez instalado nos dirigimos hacia el menú:

Applications – - > Wine – - > Programs – - > FLV Player

y seleccionamos la opción: Applian FLV Player

Applian FLV Player en Ubuntu Linux

Cabe señalar que los reproductores Totem, VLC, GXine, MPlayer pueden reproducir con la ayuda de codecs y plugins este formato FLV y quizá no sea necesario usar Wine para esto, pero es una opción más que te puede servir si la quieres probar.

Memaker build avatars for all your applications

Una aplicación interesante para crear avatars de una manera rápida y sencilla es Memaker.

¿Que es un avatar?

Según la wikipedia:

“An avatar is a computer user’s representation of himself or herself, whether in the form of a three-dimensional model used in computer games, a two-dimensional icon (picture) used on Internet forums and other communities, or a text construct found on early systems such as MUDs. It is an “object” representing the embodiment of the user. The term “avatar” can also refer to the personality connected with the screen name, or handle, of an Internet user.”

Lo interesante de la aplicación es que te permite cambiar o crear el avatar de tu usuario en tu escritorio GNOME:

Para esto solo hay que guardar el dibujo como GNOME Avatar y automáticamente se genera un archivo oculto de imagen en formato png con el nombre de face como se muestra en la imagen anterior.

Para descargar memaker visita el sitio oficial: http://memaker.org/ , en Ubuntu solo descargalo desde el gestor de paquetes Synaptic o desde el centro de software Ubuntu.

easyRAE updated v0.6

Si la configuración del idioma en tu distribución de Linux es español, easyRAE va al idioma de tu elección, por el momento solo al español, pero la base permite traducir easyRAE a cualquier lengua.

La pantalla del “Acerca de”  y detalles lo deje intencionalmente como se muestra, posteriormente sufrirá cambios para que se adapte al mismo esquema del idioma.

Para las versiones subsecuentes de easyRAE la idea es que la aplicación permita al usuario generar, exportar e importar una base de conocimiento (BC) la cual el usuario estará generando dinamicamente al momento de consultar al diccionario de la Real Academia Española. El usuario se encargara de subir, cuando lo quiera hacer, su base de conocimiento y esta base de conocimiento se actualizara cada mes y se podrá descargar, como archivo compreso, en un formato que aún estoy diseñando el cual lo único que puedo decir, por ahora, es que será un formato estándar, para no caer en dimes y diretes.

Básicamente como se muestra en la figura anterior, 5 consultas generan un total de 90KB de consultas descargadas, 1000 consultas generan 17.57 M sin compresión. Una base de conocimiento, con compresión, de 1000 consultas, da un total de 1.9 M, estamos hablando que son solo y solo aproximaciones, esto puede variar constantemente.

Sin duda alguna, esto será implementado en las próximas versiones.